توضیحات

سرفصل های آموزشی

بخش اول: مبانی برنامه‌نویسی و آمار

۱.⁠ ⁠آشنایی با بیوانفورماتیک و مفاهیم پایه
2.⁠ ⁠مقدمه‌ای بر زبان برنامه‌نویسی R
– نصب و راه‌اندازی نرم‌افزار
– اصول کدنویسی
– انواع توابع و عملگرها
3.⁠ ⁠آمار و تست‌های آماری رایج در بیوانفورماتیک
– مباحث نظری
– پیاده‌سازی مثال‌ها در محیط R

بخش دوم: تکنولوژی‌های ژنومی
4.⁠ ⁠آشنایی با تکنولوژی‌های پیشرفته:
– Microarray
– RNA-seq
– TCGA
– پایگاه داده GEO

بخش سوم: تجسم و آنالیز داده‌ها
5.⁠ ⁠رسم انواع نمودارها و کاربردهای آنها:
– نمودارهای violin plot, bar plot, heatmap, box plot
– نمودارهای آتشفشانی (volcano plot)
6.⁠ ⁠آنالیزهای تخصصی:
– محاسبه نرخ مرگ و میر بیماران سرطانی
– رسم نمودارهای بقا و پیش‌آگهی
– آنالیز داده‌های miRNA-seq
– محاسبه تفاوت بیان ژن‌ها (Differential Expression)

بخش چهارم: آنالیزهای پیشرفته
7.⁠ ⁠غنی‌سازی و تحلیل مسیرهای مرتبط با ژن‌ها:
– Gene Ontology
– Pathway analysis
8.⁠ ⁠*تحلیل شبکه‌های بیولوژیکی:
– شبکه‌های co-expression
– شبکه‌های برهمکنش پروتئین‌ها
– کار با نرم‌افزار Cytoscape

بخش پنجم: آنالیزهای تخصصی miRNA
9.⁠ ⁠شناسایی اهداف miRNAها:
– استفاده از پایگاه‌های miRWalk و TargetScan
10.⁠ ⁠تحلیل شبکه‌های ceRNA و روش رسم آنها

این دوره به صورت جامع تمامی مراحل آنالیز داده‌های ژنومی از پردازش اولیه تا تفسیر نتایج را پوشش می‌دهد و مناسب پژوهشگران حوزه‌های ژنتیک، سرطان‌شناسی و پزشکی شخصی‌سازی شده است.